La Gestión Académica es quizás la más importante, ya que gira en torno a la misión de toda Institución Educativa, es desde la gestión académica que se direccionan los procesos pedagógicos, los proyectos que en el ámbito de la institución, de área o en forma transversal, buscan que los estudiantes logren aprendizajes significativos, incluye la organización curricular, las competencias en cada una de las áreas de aprendizaje, producción de material didáctico y el sistema de evaluación, entre otros, con miras a mejorar el rendimiento académico de los estudiantes.
En este sentido, Webcolegios se adapta en lo pedagógico a la Institución Educavita siguiendo las directrices del Ministerio de Educación, las leyes y decretos que al respecto están vigentes.